本作は2015年6月24日に世界累計売上100万本を、9月末には242万本を記録。また日本国内では2015年12月に100万本を超え、これは当時の国内Wii Uユーザーの約2.5人に1人が本作を購入している計算になり、この販売数は新規IPとしては異例である。また11月12日に発売した「Wii U スプラトゥーン セット」も約1ヶ月半で完売となり、任天堂社長の君島達己も「ゲームハードごと買ってもいいと多くの方に思っていただけるソフト」と評している。また、Twitterやニコニコ動画には多くのイラストやプレイ動画の投稿が行われているなど、Web上でも盛り上がりを見せている。
本作は発売から随時無料でアップデートされ、新しいルール、ゲームモード、ブキなどが順次追加されている。発売当初はアップデート期間を半年間としていたが、2016年3月4日に配信された「Nintendo Direct 2016.3.4」にて、アップデート期間を同年夏まで延長することが発表された。